Восточное межрегиональное следственное управление на транспорте СК России образовалось на базе Западно-Сибирского следственного управления на транспорте СК России путем присоединения Дальневосточного следственного управления на транспорте СК России и Восточно-Сибирского следственного управления на транспорте СК России.
 
Руководителем Восточного межрегионального следственного управления на транспорте СК России назначен генерал-майор юстиции Алексей Анатольевич Александров, который ранее занимал должность руководителя  Западно-Сибирского следственного управления на транспорте СК России.
 
Ответственным за взаимодействие со средствами массовой информации в Восточном межрегиональном следственном управлении на транспорте СК России назначен старший помощник руководителя управления (по информационному взаимодействию с общественностью и СМИ) полковник юстиции Наталия Николаевна Чернакова press@92.sledcom.ru 8-913-208-95-08.
 
В компетенцию Восточного межрегионального следственного управления на транспорте СК России входит прием, регистрация, проверка сообщений, расследование уголовных дел о преступлениях, совершенных в сфере движения и эксплуатации водного, воздушного и железнодорожного транспорта, а также преступлений, совершенных сотрудниками таможенных органов, работниками предприятий и организаций, осуществляющих свою деятельность в сфере транспорта в Сибирском и Дальневосточном федеральных округах.